Glosario · Genética
Criterios ACMG
En una frase
Los criterios ACMG son las normas publicadas en 2015 por el American College of Medical Genetics and Genomics y la Association for Molecular Pathology para clasificar variantes genéticas en cinco categorías, de patogénica a benigna.
También se llama: criterios ACMG/AMP · guías ACMG · guía ACMG/AMP · clasificación ACMG · ACMG/AMP
¿Qué son los criterios ACMG?
Son el marco de referencia internacional para decidir si una variante genética causa o no una enfermedad mendeliana. Se publicaron en 2015 en Genetics in Medicine como recomendación conjunta del American College of Medical Genetics and Genomics (ACMG) y la Association for Molecular Pathology (AMP), con Sue Richards como primera autora. Por eso a menudo se citan como «criterios ACMG/AMP» o «Richards et al. 2015».
Antes de esta guía, cada laboratorio clasificaba con sus propias reglas y terminología. La guía propuso un lenguaje común y cinco categorías.
Cómo funcionan
La guía define 28 criterios: 16 de evidencia patogénica y 12 de evidencia benigna. Cada uno tiene un código y un peso:
- Patogénicos: muy fuerte (PVS1), fuerte (PS1–PS4), moderado (PM1–PM6) y de apoyo (PP1–PP5).
- Benignos: independiente (BA1), fuerte (BS1–BS4) y de apoyo (BP1–BP7).
Los criterios recogen distintos tipos de evidencia: frecuencia en la población (por ejemplo, en gnomAD), tipo de variante y su efecto previsto, predicciones computacionales, estudios funcionales, segregación en la familia, aparición de novo y datos de bases como ClinVar. Unas reglas de combinación asignan después una de las cinco categorías:
- Patogénica
- Probablemente patogénica
- De significado incierto (VUS)
- Probablemente benigna
- Benigna
Limitaciones y actualizaciones
- Juicio experto: aplicar cada criterio exige interpretación, y distintos laboratorios pueden llegar a categorías diferentes con los mismos datos.
- Ámbito: la guía se diseñó para variantes germinales en enfermedades mendelianas, no para variantes somáticas tumorales ni para variantes del número de copias, que tienen sus propias recomendaciones.
- Refinamientos: el grupo ClinGen y paneles de expertos por gen han publicado ajustes para criterios concretos y para genes o enfermedades específicas.
Ejemplo
Un laboratorio detecta una variante de desplazamiento del marco en un gen en el que la pérdida de función causa una enfermedad conocida. Aplica PVS1 (variante nula), PM2 (ausente en bases de datos poblacionales) y PP1 por cosegregación en la familia. Según las reglas de combinación de 2015, un criterio muy fuerte más uno moderado y uno de apoyo basta para «patogénica»; aun así, el informe detalla qué criterios se usaron para que el clínico pueda valorarlo.
Criterios ACMG en Xenogene
La plataforma Clinvar de Xenogene, dedicada a la interpretación de variantes genéticas, aplica según su ficha la clasificación según criterios ACMG/AMP dentro de un flujo de ingesta de archivos VCF, anotación con bases de datos públicas, clasificación e informe. Entre sus herramientas figura InterVar, para la clasificación ACMG automatizada. La clasificación automatizada es un apoyo: la interpretación final corresponde al profesional que solicita el estudio.
Preguntas frecuentes
¿Cuáles son las cinco categorías de clasificación ACMG?
Patogénica, probablemente patogénica, de significado incierto (VUS), probablemente benigna y benigna. Las categorías «probablemente» se usan cuando la evidencia es fuerte pero no concluyente.
¿Qué significa PVS1 en la clasificación ACMG?
Es el criterio de evidencia patogénica muy fuerte: una variante nula (sin sentido, desplazamiento del marco, sitio canónico de splicing, etc.) en un gen en el que la pérdida de función es un mecanismo conocido de enfermedad. Su aplicación tiene matices y se ha precisado en recomendaciones posteriores.
¿Dos laboratorios pueden clasificar distinto la misma variante con los criterios ACMG?
Sí. Los criterios estandarizan el proceso, pero exigen juicio experto al ponderar la evidencia. Por eso existen discrepancias entre laboratorios, que se ven, por ejemplo, en ClinVar como interpretaciones contradictorias.
Términos relacionados
- Variante genética
Una variante genética es cualquier diferencia en la secuencia de ADN de una persona respecto a una secuencia de referencia. La mayoría no tienen efecto en la salud; algunas se asocian con enfermedad o modifican el riesgo.
- ClinVar
ClinVar es una base de datos pública y gratuita del NCBI (Institutos Nacionales de Salud de EE. UU.) que reúne las interpretaciones que laboratorios y expertos envían sobre la relación entre variantes genéticas humanas y enfermedades.
- NGS (secuenciación de nueva generación)
La NGS (secuenciación de nueva generación) es un conjunto de tecnologías que leen en paralelo millones de fragmentos de ADN o ARN en una sola ejecución, lo que permite estudiar genomas, genes o comunidades microbianas completas de forma masiva.
Contenido divulgativo para profesionales sanitarios y público general. No sustituye la valoración de un profesional sanitario: la indicación e interpretación de cualquier prueba corresponde al profesional que la solicita.
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