AMC · NGS
AMC en Sangre - Análisis Metagenómico Avanzado
Análisis clínico avanzado mediante secuenciación metagenómica con nanoporos para detectar infecciones víricas, bacterianas y otros microorganismos presentes en sangre venosa
Solicitar información
- Secuenciación metagenómica con nanoporos
- Detección de infecciones víricas y bacterianas
- Análisis de sangre venosa
Descripción
¿Qué es AMC en Sangre?
El AMC de sangre (AMCS) es un análisis clínico avanzado realizado mediante secuenciación metagenómica con nanoporos, diseñado para detectar infecciones víricas, bacterianas y de otros microorganismos presentes en sangre venosa.
Utiliza técnicas de secuenciación de tercera generación (NGS) para identificar de manera exhaustiva todos los microorganismos y plásmidos de resistencia y virulencia presentes en la muestra.
Especificaciones técnicas
| Parámetro | Valor |
|---|---|
| Sensibilidad | > 99,55 % |
| Especificidad | > 99,55 % |
| Profundidad mínima | 30X |
| Amplificación PCR | No requerida |
| Tecnología | NGS de 3.ª generación |
| Longitud de lectura | > 4 Mb |
Características destacadas
- Alta calidad y precisión en secuenciación genómica
- Longitud de lectura superior a 4 Mb
- Reensamblaje fácil de genomas microbianos
- Menor índice de error
Tecnología
Secuenciación con nanoporos
Utilizamos tecnología de nanoporos de tercera generación que permite lecturas largas (> 4 Mb) para un análisis exhaustivo de todos los microorganismos presentes en la muestra de sangre.
- Lecturas de longitud superior a 4 megabases
- Reensamblaje completo de genomas microbianos
- Identificación de plásmidos de resistencia
- Detección de genes de virulencia
Sin amplificación PCR
Nuestro protocolo no requiere amplificación por PCR, eliminando sesgos y artefactos que pueden interferir con la detección precisa de microorganismos.
- Eliminación de sesgos de amplificación
- Reducción de artefactos técnicos
- Mayor fidelidad en la secuenciación
- Detección de variantes minoritarias
Alta precisión y sensibilidad
Alcanzamos una sensibilidad y especificidad superior al 99,55 % con una profundidad mínima de 30X, garantizando la detección confiable de microorganismos patógenos.
- Sensibilidad > 99,55 %
- Especificidad > 99,55 %
- Profundidad de cobertura 30X
- Menor índice de error
Flujo de trabajo
- Extracción de ADN — Extracción directa del ADN microbiano de la muestra de sangre.
- Preparación de librería — Preparación sin amplificación PCR para evitar sesgos.
- Secuenciación NGS — Secuenciación con nanoporos de tercera generación.
- Análisis bioinformático — Identificación de microorganismos y resistencias.
- Informe clínico — Reporte detallado con recomendaciones terapéuticas.
Muestra
Protocolo de recogida de muestra
| Requisito | Detalle |
|---|---|
| Tipo de muestra | Sangre venosa (muestra principal) |
| Volumen | 5-10 ml |
| Anticoagulante | EDTA (tubo morado) |
Condiciones de transporte
| Condición | Requisito |
|---|---|
| Temperatura | 2-8 °C (refrigerada) |
| Tiempo máximo | 48 horas |
| Contenedor | Embalaje específico para transporte |
| Etiquetado | Identificación clara del paciente |
Consideraciones importantes
- Extracción antes del inicio de antibioterapia (si es posible)
- Técnica aséptica para evitar contaminación
- Identificación correcta del paciente
- Conservación en frío hasta el procesamiento
- Evitar congelación de la muestra
Información clínica requerida
- Datos demográficos del paciente
- Sintomatología clínica actual
- Tratamientos antimicrobianos previos
- Sospecha diagnóstica
- Contexto clínico (UCI, trasplante, etc.)
Resultados
Detección de microorganismos
| Grupo | Alcance de la detección |
|---|---|
| Bacterias | Especies patógenas y comensales |
| Virus | Detección de ADN y ARN viral |
| Hongos | Levaduras y hongos filamentosos |
| Parásitos | Protozoos y otros patógenos |
| Micobacterias | M. tuberculosis y micobacterias atípicas |
Resistencia antimicrobiana
| Elemento | Descripción |
|---|---|
| Plásmidos de resistencia | Elementos genéticos móviles |
| Genes de resistencia | Mecanismos específicos |
| Factores de virulencia | Genes de patogenicidad |
| Predicción fenotípica | Susceptibilidad antimicrobiana |
Tiempo de entrega de resultados
| Fase | Momento |
|---|---|
| Recepción | Día 0 — Llegada de la muestra al laboratorio |
| Procesamiento | Días 1-10 — Secuenciación y análisis |
| Informe | Día 12 — Entrega del informe clínico |
Recomendaciones clínicas
- La correlación con la clínica del paciente es fundamental
- Considerar la posible contaminación en casos de cocos grampositivos
- La ausencia de detección no excluye infección
- Los resultados deben interpretarse en contexto clínico
- Consultar con especialista en microbiología clínica si es necesario
Indicaciones clínicas
Indicaciones prioritarias
- Sepsis y shock séptico — Diagnóstico rápido en pacientes críticos.
- Bacteriemia en pacientes inmunodeprimidos — Trasplantados, oncológicos, VIH.
- Infecciones nosocomiales — Resistencias multidrogas sospechadas.
- Fiebre de origen desconocido — Cuando los métodos convencionales fallan.
Indicaciones secundarias
- Endocarditis infecciosa
- Infecciones en prótesis vasculares
- Meningitis de etiología desconocida
- Osteomielitis crónica
- Infecciones en catéteres intravasculares
Especialidades que lo solicitan
Medicina Intensiva · Cardiología · Infecciones Clínicas · Oncología · Neumología · Nefrología · Cirugía · Pediatría
Ventajas del AMC en Sangre
- Detección amplia de microorganismos
- Identificación de resistencias
- No requiere cultivo previo
- Mayor sensibilidad que los cultivos
- Resultados en 15 días